Αγοράζοντας ηλεκτρονικό τσιγάρο, σε κάθε πακέτο περιέχονται δύο ολοκληρωμένα τσιγάρα (μπαταρία, ατμοποιητής και φίλτρο) και ένας φορτιστής. Για τη λειτουργία του ηλεκτρονικού τσιγάρου πρέπει καταρχάς να είναι φορτισμένη η μπαταρία. Η φόρτιση γίνεται συνδέοντας τη μπαταρία με τον φορτιστή και τον φορτιστή μέσω USB με υπολογιστή ή με πρίζα. Έχοντας και τα δύο τσιγάρα φορτισμένα θα υπάρχει ασφάλεια ότι δεν θα ξεμείνει ο ατμιστής από τσιγάρο. Αν το ηλεκτρονικό τσιγάρο έχει ατμοποιητή τύπου tank το υγρό αναπλήρωσης τοποθετείται στο φίλτρο και το φίλτρο συνδέεται με τον ατμοποιητή απλά πιέζοντας το ένα μες στο άλλο. Για ατμοποιητές cartomizer το υγρό αναπλήρωσης τοποθετείται απευθείας στον ατμοποιητή μέσω μιας μικρής υποδοχής. Τα υγρά αναπλήρωσης για cartomizer έχουν ειδικό στόμιο στο φιαλίδιο για την αναπλήρωση. Τέλος για να λειτουργήσει πρέπει να βιδωθεί η μπαταρία στον ατμοποιητή. Τώρα το ηλεκτρονικό τσιγάρο είναι έτοιμο για χρήση.
Σε ηλεκτρονικά τσιγάρα με αυτόματη μπαταρία απλά γίνεται εισπνοή από το φίλτρο όπως ακριβώς στο κανονικό τσιγάρο. Αν υπάρχει φως LED αυτό θα ανάψει. Όταν η μπαταρία δεν είναι αυτόματη, κατά την εισπνοή πρέπει να παραμένει πατημένο το κουμπί που υπάρχει στην επιφάνεια της μπαταρίας. Με το πάτημα του κουμπιού, αυτό ανάβει και δηλώνει ότι η μπαταρία βρίσκεται σε λειτουργία.
Για το κλείδωμα της μπαταρίας ώστε να μην γίνει αθέλητη λειτουργία, υπάρχει μια διαδικασία ανάλογα με τον τύπο του ηλεκτρονικού τσιγάρου, π.χ. με πάτημα του διακόπτη της μπαταρίας κάποιες διαδοχικές φορές. Με τον ίδιο τρόπο ξεκλειδώνει. Για μεγαλύτερη διάρκεια ζωής της μπαταρίας και του ατμοποιητή προτείνεται να μην γίνεται παρατεταμένο πάτημα του κουμπιού, κάτι που θα προκαλέσει υπερθέρμανση.
